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Registro Completo |
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Biblioteca(s): |
Embrapa Amapá. |
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Data corrente: |
13/02/2017 |
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Data da última atualização: |
13/02/2017 |
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Tipo da produção científica: |
Resumo em Anais de Congresso |
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Autoria: |
PASSO, J. F.; ZUCCHI, R. A.; RONCHI-TELES, B.; BARR, N. B.; MCPHERON, B. A.; ARAÚJO, E.; ADAIME, R.; SILVA, J. G. |
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Afiliação: |
JOSEANE FERNANDA PASSOS, UESC; ROBERTO ANTONIO ZUCCHI, ESALQ/USP; BEATRIZ RONCHI-TELES, INPA; RAUL RUIZ-ARCE, United States Department of Agriculture, Texas; BRUCE A. MCPHERON, Ohio State University; ELTON ARAUJO, UFERSA; RICARDO ADAIME DA SILVA, CPAF-AP; JANISETE GOMES SILVA, UESC. |
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Título: |
Phylogenetic analysis of Anastrepha obliqua (Macquart) populations in Brazil. |
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Ano de publicação: |
2016 |
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Fonte/Imprenta: |
In: MEETING OF THE TEPHRITID WORKERS OF THE WESTERN HEMISPHERE, 9th., 2016. Buenos Aires. Book of Abstracts... [Buenos Aires: FAO: AIEA, 2016]. p. 202. |
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Idioma: |
Português |
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Conteúdo: |
Introduction: The West Indian fruit fly, Anastrepha obliqua, is a major pest of tropical fruits infesting a wide variety of hosts and in Brazil it is the second most frequent species in the genus. Molecular analyses have shown that A. obliqua does not represent a monophyletic group. This would suggest the need for more detailed studies about population structure. We sequenced a portion of genomic regions COI, ITS, Period and ND6 from A. obliqua gathered in Brazil. Methods: Forty two specimens were collected from fruits and traps from 25 geographic sites in eleven states in Brazil. Methods: DNA was isolated and a partial fragment of each genomic region was amplified by the Polymerase Chain Reaction, then sequenced. The sequences were concatenated in a sequence matrix. We performed partition analysis for each genomic region to choose the best evolution model. A Bayesian phylogenetic tree was constructed and analyses for population structure and demographics were estimated. Results: A fragment of 2,184 bp contained 78 variable sites e genetic distance of 2.8% between clades. A total of 33 haplotypes (designated H1-H33) were observed with haplotype diversity of 0.9884. We observed two clades. Clade I consisted of mostly Northeastern collections and clade II of collections from the Northern region. We saw that haplotypes recovered from individuals gathered in Pará and Amapá were present in both clades. Conclusion: Our results show high haplotype diversity and two clusters of A. obliqua in the phylogenetic tree with exclusive haplotypes in each region, which can have resulted from a decrease in gene flow between populations due to geographic distance. MenosIntroduction: The West Indian fruit fly, Anastrepha obliqua, is a major pest of tropical fruits infesting a wide variety of hosts and in Brazil it is the second most frequent species in the genus. Molecular analyses have shown that A. obliqua does not represent a monophyletic group. This would suggest the need for more detailed studies about population structure. We sequenced a portion of genomic regions COI, ITS, Period and ND6 from A. obliqua gathered in Brazil. Methods: Forty two specimens were collected from fruits and traps from 25 geographic sites in eleven states in Brazil. Methods: DNA was isolated and a partial fragment of each genomic region was amplified by the Polymerase Chain Reaction, then sequenced. The sequences were concatenated in a sequence matrix. We performed partition analysis for each genomic region to choose the best evolution model. A Bayesian phylogenetic tree was constructed and analyses for population structure and demographics were estimated. Results: A fragment of 2,184 bp contained 78 variable sites e genetic distance of 2.8% between clades. A total of 33 haplotypes (designated H1-H33) were observed with haplotype diversity of 0.9884. We observed two clades. Clade I consisted of mostly Northeastern collections and clade II of collections from the Northern region. We saw that haplotypes recovered from individuals gathered in Pará and Amapá were present in both clades. Conclusion: Our results show high haplotype diversity and two clusters of A. o... Mostrar Tudo |
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Palavras-Chave: |
Diversidade genética; Fruit fly; Genetic diversity; India Ocidental; Mosca da fruta; Plant pest; West Indian. |
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Thesagro: |
Praga de planta. |
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Categoria do assunto: |
O Insetos e Entomologia |
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URL: |
https://ainfo.cnptia.embrapa.br/digital/bitstream/item/155520/1/CPAF-AP-2016-Phylogenetic-analysis-of-Anastrepha-obliqua.pdf
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Marc: |
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005 2017-02-13
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245 $aPhylogenetic analysis of Anastrepha obliqua (Macquart) populations in Brazil.$h[electronic resource]
260 $aIn: MEETING OF THE TEPHRITID WORKERS OF THE WESTERN HEMISPHERE, 9th., 2016. Buenos Aires. Book of Abstracts... [Buenos Aires: FAO: AIEA, 2016]. p. 202.$c2016
520 $aIntroduction: The West Indian fruit fly, Anastrepha obliqua, is a major pest of tropical fruits infesting a wide variety of hosts and in Brazil it is the second most frequent species in the genus. Molecular analyses have shown that A. obliqua does not represent a monophyletic group. This would suggest the need for more detailed studies about population structure. We sequenced a portion of genomic regions COI, ITS, Period and ND6 from A. obliqua gathered in Brazil. Methods: Forty two specimens were collected from fruits and traps from 25 geographic sites in eleven states in Brazil. Methods: DNA was isolated and a partial fragment of each genomic region was amplified by the Polymerase Chain Reaction, then sequenced. The sequences were concatenated in a sequence matrix. We performed partition analysis for each genomic region to choose the best evolution model. A Bayesian phylogenetic tree was constructed and analyses for population structure and demographics were estimated. Results: A fragment of 2,184 bp contained 78 variable sites e genetic distance of 2.8% between clades. A total of 33 haplotypes (designated H1-H33) were observed with haplotype diversity of 0.9884. We observed two clades. Clade I consisted of mostly Northeastern collections and clade II of collections from the Northern region. We saw that haplotypes recovered from individuals gathered in Pará and Amapá were present in both clades. Conclusion: Our results show high haplotype diversity and two clusters of A. obliqua in the phylogenetic tree with exclusive haplotypes in each region, which can have resulted from a decrease in gene flow between populations due to geographic distance.
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700 1 $aSILVA, J. G.
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Registro original: |
Embrapa Amapá (CPAF-AP) |
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| Registros recuperados : 70 | |
| 21. |  | BARTZ, M. L. C.; TRIERVEILER, S.; ROSA, M. G. da; BROWN, G. G.; JAMES, S. W.; DECAENS, T.; BARETTA, D. Populações de minhocas em diferentes sistemas de uso do solo na região leste do Estado de Santa Catarina. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 31.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 15.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 13.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 10., 2014, Araxá. Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologias para todos: anais. Araxá: Núcleo Regional Leste da Sociedade Brasileira de Ciência do Solo, 2014. Resumo. FERTBIO 2014.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 22. | | BARTZ, M. L. C.; BROWN, G. G.; JAMES, S. W.; DECÄENS, T.; ROSA, M. G. da; TRIERVEILER, S.; BARETTA, D. Riqueza de espécies de minhocas em sistema de uso do solo em Santa Catarina, Brasil. In: ENCONTRO NACIONAL DE PLANTIO DIRETO NA PALHA, 14., 2014, Bonito. Sistema plantio direto: produzindo água e alimentando o mundo: resumos. Brasília, DF: Embrapa, 2014. Disponibilizado online.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 23. | | SANTOS, A.; SILVA, E. da; CUNHA, L.; STANTON, D.; KILLE, P.; DECAËNS, T.; JAMES, S. W.; BARTZ, M. L. C.; BROWN, G. G.; TERRA PRETO DE ÍNDIO NETWORK. Abundância, biomassa e riqueza de minhocas em áreas de Terra Preta de Índio (TPI) em Manaus e Iranduba (AM). In: ENCONTRO LATINO-AMERICANO DE ECOLOGIA E TAXONOMIA DE OLIGOQUETAS, 5; SIMPÓSIO ENGENHEIROS EDÁFICOS, FERTILIDADE DO SOLO E TERRA PRETA DE ÍNDIO (TPI), 2015, Curitiba. Anais. [S.l.]: Federação Brasileira de plantio direto de irrigação, 2015. p. 107. Disponível online. Resumo. 5° ELAETAO.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 24. | | FELIZARDO, S. P. S.; SILVA, J. G. S.; HARADA, A. Y.; MARICHAL, R.; TSELOUIKO, S.; PRAXEDES, C.; DECAENS, T.; BROWN, G. G.; VELASQUEZ, E.; LAVELLE, P. Comparação da mirmecofauna de solo em três áreas no Pará, Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOLOGIA, 28., 2010, Belém. Biodiversidade e sustentabilidade: resumos. Belém, PA: Sociedade Brasileira de Zoologia, 2010. p. 874.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 25. | | KLAUBERG FILHO, O.; TSAI, S. M.; BROWN, G. G.; BARTZ, M.; LUIZ MAFRA, A. L.; DECAËNS, T.; SOUSA, J. P.; BARETTA, C. M.; STÜRMER, S. L.; BARETTA, D. Soil quality and biodiversity across a land-use intensification gradient in Santa Catarina, Brazil. In: INTERNATIONAL COLLOQUIUM ON SOIL ZOOLOGY, 16., 2012, Coimbra. Book of abstracts. Coimbra: University of Coimbra, 2012. p. 76.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 26. | | BARTZ, M. L. C.; BROWN, G. G.; KLAUBER FILHO, O.; ROSA, M. G. da; LOCATELLI, M.; ORSO, R.; ZORTÉA, T.; CASAROTTO, K.; DECÄENS, T.; BARETTA, D. Diversidade de minhocas e atributos químicos em sistemas de plantio direto e integração lavoura-pecuária do oeste catarinense. In: ENCONTRO NACIONAL DE PLANTIO DIRETO NA PALHA, 13., 2012, Passo Fundo. Sistema plantio direto, em constante evolução: resumos. Passo Fundo: Febrapdp, 2012. CD-ROM. Resumo também apresentado no CONGRESSO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2., 2012, São Leopoldo. Mostra de iniciação científica da UNISINOS. São Leopoldo: Casa Leiria, 2012. e-book. II CICPG. Disposição dos autores: ORSO, R.;...| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 27. | | DECAËNS, T.; PORCO, D.; JAMES, S. W.; BROWN, G. G.; SILVA, E. da; DUPONT, L.; LAPIED, E.; ROUGERIE, R.; TABERLET. P.; ROY, V. Dissecting tropical earthworm biodiversity patterns in tropical rainforests through the use of DNA barcoding. In: ENCONTRO LATINO-AMERICANO DE ECOLOGIA E TAXONOMIA DE OLIGOQUETAS, 5; SIMPÓSIO ENGENHEIROS EDÁFICOS, FERTILIDADE DO SOLO E TERRA PRETA DE ÍNDIO (TPI), 2015, Curitiba. Anais. [S.l.]: Federação Brasileira de plantio direto de irrigação, 2015. p. 14. Disponível online. Resumo. 5° ELAETAO.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 28. | | BARTZ, M. L. C.; BROWN, G. G.; JAMES, S. W.; DECAENS, T.; RODA, M. G. da; SOUZA, S. T. de; BARETTA, D. Earthworm abundance in land-use systems in Santa Catarina state, Brazil. In: GLOBAL SOIL BIODIVERSITY CONFERENCE, 1., 2014, Dijon. Assessing soil biodiversity and role in ecosystem services: book of abstracts. [S.l.]: Global Soil Biodiversity Initiative, 2014. p. 559.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 29. | | BARTZA, M. L. C.; BROWN, G. G.; ROSA, M. G. da; KLAUBERG FILHO, O.; JAMES, S. W.; DECAËNS, T.; BARETTA, D. Earthworm richness in land-use systems in Santa Catarina, Brazil. Applied Soil Ecology, v. 83, p. 59-70, Nov. 2014. XVI International Colloquium on Soil Zoology & XIII International Colloquium on Apterygota, 2012, Coimbra. Selected papers.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: A - 1 |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 30. | | SILVA, E. da; JAMES, S. W.; ROSA, M. G. da; SCHUHLI, G. S. e; BARTZ, M. L. C.; DECAENS, T.; BROWN, G. G. DNA barcode for earthworm taxonomy, biodiversity assessment and conservation of Brazilian species. In: ANNUAL MEETING OF THE ASSOCIATION FOR TROPICAL BIOLOGY AND CONSERVATION, 53., 2016, Montpellier. Tropical ecology and society reconciliating conservation and suatainable use of biodiversity: program & abstracts. [S.l.]: ATBC, 2016. p. 96.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 31. | | ROUGERIE, R.; DECAËNS, T.; DEHARVERNG, L.; PORCO, D.; JAMES, S. W.; CHANG, C.-H.; RICHARD, B.; MIKHAIL, P.; SUHARDJONO, Y.; HEBERT, P. D. N. DNA barcodes for soil animal taxonomy Pesquisa Agropecuária Brasileira, Brasília, DF, v. 44, n. 8, p. 789-801, ago. 2009 Título em português: Código de barras de DNA para a taxonomia de animais do solo.| Biblioteca(s): Embrapa Unidades Centrais. |
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| 32. | | LAVELLE, P.; SPAIN, A.; BLOUIN, M.; BROWN, G. G.; DECAENS, T.; GRIMALDO, M.; JIMÉNEZ, J. J.; McKEY, D.; MATHIEU, J.; VELASQUEZ, E.; ZANGERLÉ, A. Ecosystem engineers in a self-organized soil: a review of concepts and future research questions. Soil Science, v. 181, n. 3/4, p. 91-109, Mar./Apr. 2016.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: B - 1 |
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| 33. | | TAHERI, S.; JAMES, S. W.; DECAËNS, T.; ROY, V.; ROUGERIE, R.; WILLIAMS, B.; ANDERSON, F.; BROWN, G. G.; CUNHA, L.; SILVA, E. da; CHANG, C.; DUPONT, L. Phylogenetic assessment within a complex of tropical peregrine species, Pontoscolex corethrurus. In: ANNUAL MEETING OF THE ASSOCIATION FOR TROPICAL BIOLOGY AND CONSERVATION, 53., 2016, Montpellier. Tropical ecology and society reconciliating conservation and suatainable use of biodiversity: program & abstracts. [S.l.]: ATBC, 2016. p. 98.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 34. | | SILVA, E. da; ROSA, M. G. da; SCHUHLI, G. S. e; JAMES, S. W.; DECÄENS, T.; BARTZ, M. L. C.; NADOLNY, H.; FEIJOO, A.; BROWN, G. G. O potencial do DNA barcoding para a identificação e conservação de espécies de minhocas brasileiras. In: MOREIRA, F. M. de S.; KASUYA, M. C. M. (Ed.). Fertilidade e biologia do solo: integração e tecnologia para todos. Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Ciência de Solo, 2017. v. 2 Palestra 3. FERTBIO 2014.| Tipo: Capítulo em Livro Técnico-Científico |
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| 35. | | LO-MAN-HUNG, N. F.; MARICHAL, R.; BONALDO, A. B.; TSOLOUIKO, S.; PRAXEDES, C.; BROWN, G. G.; VELASQUEZ, E.; DECAENS, T.; MARTINS, M.; LAVELLE, P. Impacto do uso do solo nas comunidades de aracnídeos de solo em três áreas do Sudoeste do Pará, Brasil. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE ZOOLOGIA, 28., 2010, Belém. Biodiversidade e sustentabilidade: resumos. Belém, PA: Sociedade Brasileira de Zoologia, 2010. p. 99.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 36. | | DUBS, F.; DECAËNS, T.; HEDDE, M.; GEOFFROY, J. J.; BOUTH, M. le; GARNIER, A.; BOGUCKI, C.; LANGLOIS, E.; BUREAU, F.; MARGERIE, P.; AUBERT, M.; LAVELLE, P. Surrounding landscape effects on local community of soil macrofauna detritivore. In: INTERNATIONAL COLLOQUIUM ON SOIL ZOOLOGY, 15; INTERNATIONAL COLLOQUIUM ON APTERYGOTA, 12., 2008, Curitiba. Biodiversity, conservation and sustainabele management of soil animal: abstracts. Colombo: Embrapa Florestas. Editors: George Gardner Brown; Klaus Dieter Sautter; Renato Marques; Amarildo Pasini. 1 CD-ROM.| Biblioteca(s): Embrapa Florestas. |
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| 37. | | BROWN, G. G.; SCHUHLI, G. S. e; JAMES, S. W.; BARTZ, M. L. C.; BARETTA, D.; LOCATELLI, M.; DECÄENS, T.; BUSCH, E.; STEFFEN, G. P. K.; ANTONIOLLI, Z. I. Barconding facilitates Brazilian earthworm taxonomy. In: INTERNATIONAL OLIGOCHAETE TAXONOMY MEETING, 6., 2013, Palmeira de Faro, Portugal. Book of abstracts. [Braga]: University of Minho, CBMA, 2013. p. 17.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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| 38. | | MELEM JUNIOR, N. J.; FONSECA, I. C. de B.; BRITO, O. R.; DECAËNS, T.; CARNEIRO, M. M.; MATOS, M. de F. A. de; GUEDES, M. C.; QUEIROZ, J. A. L. de; BARROSO, K. de O. Análise de componentes principais para avaliação de resultados analíticos da fertilidade de solos do Amapá. Semina: Ciências Agrárias, Londrina, v. 29, n. 3, p. 499-506, jul./set. 2008.| Tipo: Artigo em Periódico Indexado | Circulação/Nível: Nacional - A |
| Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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| 39. | | MELEM JUNIOR, N. J.; FONSECA, I. C. de B.; BRITO, O. R.; DECAËNS, T.; CARNEIRO, M. M.; MATOS, M. de F. A. de; GUEDES, M. C.; QUEIROZ, J. A. L. de; BARROSO, K. de O. Caracterização da fertilidade dos solos do Estado do Amapá. In: REUNIÃO BRASILEIRA DE FERTILIDADE DO SOLO E NUTRIÇÃO DE PLANTAS, 27.; REUNIÃO BRASILEIRA SOBRE MICORRIZAS, 11.; SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MICROBIOLOGIA DO SOLO, 9.; REUNIÃO BRASILEIRA DE BIOLOGIA DO SOLO, 6., 2006, Bonito, MS. A busca das raízes: anais. Dourados: Embrapa Agropecuária Oeste, 2006. 1 CD-ROM. (Embrapa Agropecuária Oeste. Documentos, 82).| Biblioteca(s): Embrapa Amapá. |
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| 40. | | LO-MAN-HUNG, N. F.; MARICHAL, R.; BONALDO, A. B.; CARVALHO, L. S.; INDICATTI, R. P.; TSELOUIKO, S.; PRAXEDES, C.; BROWN, G. G.; VELASQUEZ, E.; DECAËNS, T.; MARTINS, M.; LAVELLE, P. Impact of land management on soil arachnofauna (Arachnida) in the southwest Pará, Brazil. In: INTERNATIONAL CONGRESS OF ARACHNOLOGY, 18., 2010, Siedlce. Book of abstracts... Siedlce: University of Podlasie: International Society of Arachnology, 2010. p. 251-253.| Tipo: Resumo em Anais de Congresso |
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